194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1517 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  100 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  74.32 
 
 		 309 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  60.92 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  61.02 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  61.35 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  61.82 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  37.68 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  37.04 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  32.55 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  34.23 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  32.47 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  35.19 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.93 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  38.13 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  34.44 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  32.87 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  35.25 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  35.25 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.72 
 
 		 424 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  34.98 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  37.33 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  34.02 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  29.26 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  33 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  36.79 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  30.94 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  32.73 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  33.85 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  31.76 
 
 		 329 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  33.85 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  32.65 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  34.59 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  31.15 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.17 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  33.71 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  32.99 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  31.39 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  33.07 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  32.97 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  37.28 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  32.97 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  33.46 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  27.5 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.42 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  29.25 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  31.52 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.29 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.43 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 393 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.77 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  21.66 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.15 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.03 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  21.66 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.59 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  20.48 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.55 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  22.33 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  22.33 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.21 
 
 		 538 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25.62 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.9 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.18 
 
 		 412 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  27.72 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 		 525 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.32 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.32 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.43 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.87 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  20.62 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  20.62 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  22.27 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>