More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4516 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  100 
 
 		 436 aa  848    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  70.59 
 
 		 443 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  69.02 
 
 		 411 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  72.46 
 
 		 341 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  72.6 
 
 		 310 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  71.01 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  72.24 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  71.01 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  71.64 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  71.64 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  71.53 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  71.64 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  71.38 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  71.64 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  69.93 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  73.31 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  71.27 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  60 
 
 		 324 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  58.72 
 
 		 311 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  52.29 
 
 		 305 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  55.71 
 
 		 305 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  38.85 
 
 		 321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  39.86 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  37.15 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  40.68 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  37.41 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  37.45 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  35.56 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  40.37 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  38.91 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  40 
 
 		 324 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  31.64 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.74 
 
 		 311 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.5 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  35.79 
 
 		 321 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  38.61 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  32.09 
 
 		 307 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  30.5 
 
 		 305 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  34.2 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  38.36 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  38.36 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  44.66 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 292 aa  146  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  35.79 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  35.66 
 
 		 299 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 322 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  36.96 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  33.55 
 
 		 320 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  31.29 
 
 		 370 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.89 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  34.36 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  37.79 
 
 		 303 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  28.52 
 
 		 299 aa  133  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  34.31 
 
 		 314 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  37.99 
 
 		 306 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  37.98 
 
 		 294 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.88 
 
 		 331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.62 
 
 		 393 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 306 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 322 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 322 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 309 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.51 
 
 		 306 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  29.51 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.15 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.45 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  22.35 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  29.33 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  28.06 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>