115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3282 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  100 
 
 		 306 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  48.24 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.36 
 
 		 424 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  29.57 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  26.86 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  29.93 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  26.83 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  26.33 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  25.66 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  28.36 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  25.96 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  26.51 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  25.34 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  24.71 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 436 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  24.22 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  24.31 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  23.94 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  22.81 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  23.85 
 
 		 443 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  22.96 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  21.69 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  26.41 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  23.98 
 
 		 427 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.28 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  24.73 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  22.45 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  24.62 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  25.64 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  25 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  22.71 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  23.56 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  20.63 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  20.73 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  20.9 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  21.52 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  20.9 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  21.45 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  21.31 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.75 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  21.05 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  23.45 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  21.54 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  21.4 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  21.93 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  24.14 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  21.48 
 
 		 525 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  22.65 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  21.52 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  21.48 
 
 		 525 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  23.39 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  23.39 
 
 		 437 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  23.02 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  23.57 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.09 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.09 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  23.39 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  23.73 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  20.63 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>