More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2481 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  62.37 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  60.14 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  55.34 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  53.85 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  55.02 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  55.02 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  58.48 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  55.02 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  55.41 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  55.97 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  56.49 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  56.49 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  59.27 
 
 		 436 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  56.14 
 
 		 308 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  55.44 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  55.44 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  58.63 
 
 		 443 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  56.14 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  60.21 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  58.62 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  38.31 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  38.33 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.95 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  35.4 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  40.87 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.11 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  35 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  33.1 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35.49 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  39.72 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  32.21 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  35.4 
 
 		 427 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  40.07 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  40.07 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  33.67 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  29.82 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  32.29 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.62 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  34.08 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  34.5 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.7 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35.47 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35.47 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  36.86 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  32.67 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  40.6 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.66 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  32.11 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.92 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  36.5 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.75 
 
 		 393 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.04 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.63 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  28.16 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  33.54 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  36.17 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  36.63 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.94 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.16 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  29.04 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  29.08 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  26.13 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  23.42 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.89 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.49 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.93 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  28.15 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.56 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.86 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.87 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.62 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.75 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>