More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0874 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  92.78 
 
 		 386 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  99.74 
 
 		 388 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  100 
 
 		 388 aa  777    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  75.07 
 
 		 375 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  62.09 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  63.33 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  59.89 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  53.38 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  53.89 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  53.37 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  55.75 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  56.92 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  49.42 
 
 		 347 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  47.7 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  52.73 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  54.45 
 
 		 384 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  49.69 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  48.17 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  49.42 
 
 		 348 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  50.8 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  50.8 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  49.36 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  50 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  49.37 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  54.58 
 
 		 360 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  48.87 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  49.52 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  46.11 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  50.35 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  45.34 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  45.15 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  46.95 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  46.93 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  48.13 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  41.69 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  43.55 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  40.74 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  48.45 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  40.54 
 
 		 317 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  38.39 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  37.74 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  36.36 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.77 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  34.07 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  39.4 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.53 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  38.06 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  37.02 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  34.06 
 
 		 318 aa  159  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.65 
 
 		 330 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  35.2 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.42 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  32.41 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33.02 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  31.85 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.7 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 278 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  34.06 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  32.96 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  32.96 
 
 		 289 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  32.84 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  32.34 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  32.34 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  32.44 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  34.42 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  33.84 
 
 		 278 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  33.84 
 
 		 278 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  31.46 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 291 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  34.32 
 
 		 301 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  31.07 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  31.34 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.39 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.88 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  32.89 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  31.31 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  32.99 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  32.99 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  31.11 
 
 		 277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.82 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  30.64 
 
 		 321 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 299 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>