More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4297 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 384 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  65.36 
 
 		 386 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  64.4 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  55.1 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  51.46 
 
 		 397 aa  322  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  50.74 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  51.46 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  50.65 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  53.25 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  52.92 
 
 		 375 aa  316  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  52.92 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  50.97 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  53.82 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  45.77 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  54.45 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  46.6 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  45.83 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  45.83 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  48.52 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  46.13 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  47.08 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  49.68 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  42.5 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  43.11 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  43 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  41.53 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  41.29 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  41.1 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  47.25 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  39.94 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  43.1 
 
 		 317 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  38.08 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  37.27 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  39.94 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  39.75 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  38.11 
 
 		 318 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  34.48 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  36.14 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  34.97 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  35.64 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  36.62 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  34.28 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  33.63 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  35.48 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  35.59 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.87 
 
 		 313 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  34.2 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  33.78 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.41 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  35.56 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.99 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  35.09 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.75 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.68 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  34.34 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  34.34 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  32.23 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.09 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.34 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.74 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  31.77 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  31.94 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.18 
 
 		 359 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.66 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.66 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.66 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  32.29 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.74 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.42 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  29.59 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.54 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.07 
 
 		 317 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  30.66 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.21 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  29.56 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  30.03 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  32.77 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  28.93 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  29.69 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.69 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  29.69 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.52 
 
 		 286 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.37 
 
 		 289 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  26.78 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>