283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1838 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
301 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  58.51 
 
 
304 aa  331  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  59.43 
 
 
306 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  44.57 
 
 
291 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  45.05 
 
 
299 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  42.22 
 
 
360 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  43.17 
 
 
306 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  38.54 
 
 
317 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  41.79 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  39.57 
 
 
347 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  36.97 
 
 
305 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  37.33 
 
 
322 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  39.92 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  37.54 
 
 
316 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  36.39 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  39.93 
 
 
312 aa  188  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.26 
 
 
300 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.16 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  37.27 
 
 
323 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  34.4 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  40.07 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  33.1 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  39.71 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  39.71 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  40.81 
 
 
324 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  40.3 
 
 
321 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  37.31 
 
 
370 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  39.76 
 
 
298 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40.31 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  39.54 
 
 
329 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  37.82 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  37.69 
 
 
310 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  36.2 
 
 
299 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  38.22 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  37.41 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  38.22 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  38.22 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  36.82 
 
 
443 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  36.86 
 
 
324 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  37.41 
 
 
311 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  42.86 
 
 
303 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  37 
 
 
436 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  36.3 
 
 
411 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.41 
 
 
299 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  38.31 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  38.78 
 
 
337 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  38.11 
 
 
304 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  38.11 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  38.11 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  38.71 
 
 
307 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  38.11 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.94 
 
 
311 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.44 
 
 
393 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.67 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  33.2 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.76 
 
 
292 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.84 
 
 
292 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.09 
 
 
321 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  34.63 
 
 
305 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  32.85 
 
 
334 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.58 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  29.7 
 
 
276 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  30.18 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.77 
 
 
331 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.18 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.4 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.82 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  29.56 
 
 
307 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.17 
 
 
305 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  31.14 
 
 
302 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.22 
 
 
306 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  29.49 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.42 
 
 
322 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.42 
 
 
322 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.76 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.82 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.31 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.66 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  27.72 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  27.44 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.72 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.71 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.72 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.25 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.37 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.82 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.14 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  29.03 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  27.04 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.97 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  29.76 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.24 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.24 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  27.86 
 
 
437 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.88 
 
 
405 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  28.46 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  28.63 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.67 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  28.63 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.38 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>