277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2621 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  100 
 
 
304 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  62.96 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  58.51 
 
 
301 aa  305  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  45.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  42.71 
 
 
360 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  43.06 
 
 
321 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  41.7 
 
 
299 aa  205  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  40.56 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  38.03 
 
 
291 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  36.3 
 
 
317 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  37 
 
 
322 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  37.21 
 
 
370 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  39.23 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  34.12 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  35.23 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.08 
 
 
316 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  36.07 
 
 
323 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  34.8 
 
 
305 aa  178  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  40.59 
 
 
321 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  39.69 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  34.21 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  41.33 
 
 
427 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37.15 
 
 
298 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  39.85 
 
 
324 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.11 
 
 
312 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  40.23 
 
 
329 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  40.23 
 
 
329 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  37.06 
 
 
321 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.43 
 
 
299 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  40.91 
 
 
329 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  41.61 
 
 
303 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.6 
 
 
299 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  39.66 
 
 
326 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  35.93 
 
 
341 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  36.06 
 
 
311 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  34.69 
 
 
314 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  34.69 
 
 
314 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  34.96 
 
 
308 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  35.84 
 
 
443 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  35.58 
 
 
310 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  32.99 
 
 
302 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  35.52 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.34 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.56 
 
 
411 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.11 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  33.57 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.27 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.13 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.33 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.29 
 
 
304 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.29 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  32.61 
 
 
337 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.29 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.29 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.02 
 
 
307 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  34.3 
 
 
331 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.59 
 
 
311 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.53 
 
 
334 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.62 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.48 
 
 
292 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.44 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.77 
 
 
305 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.77 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.32 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  31.91 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  29.21 
 
 
307 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  28.36 
 
 
306 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  30.04 
 
 
305 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  30.58 
 
 
314 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  27.68 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  31.58 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.11 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  25.26 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.92 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.92 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.42 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  26.79 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  27.68 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.37 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  22.99 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  29.11 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.72 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.87 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.14 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  29.18 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  27.61 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  26.3 
 
 
425 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  27.82 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  27.98 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  27.78 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  27.78 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  27.78 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  27.78 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  27.78 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  25.95 
 
 
484 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.47 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  28.15 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  25.65 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  28.15 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>