161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2354 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  100 
 
 		 327 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  49.82 
 
 		 361 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  45.3 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  44.7 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  44.62 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  44.76 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  41.2 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  39.5 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  37.73 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  36.08 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  37.72 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  35.51 
 
 		 431 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  34.58 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  33.99 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  31.38 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  32.52 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.14 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.41 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  28.09 
 
 		 463 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.92 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.76 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.32 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.52 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.11 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.35 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.92 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  25.53 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  24.12 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.45 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  25.76 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  25.76 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.18 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  24.24 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  20.23 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.32 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  29.5 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  24.24 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  24.24 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.45 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  21.41 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.85 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  23.23 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  23.67 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  23.86 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.52 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.39 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  20.27 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25.34 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  22.67 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  25.18 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  22.88 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.69 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  24.2 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  24 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.84 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  23.17 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  25.26 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  22.98 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.36 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  23.71 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>