211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0327 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1329  putative molybdopterin biosynthesis protein  66.04 
 
 
273 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0692  ribonuclease BN  66.27 
 
 
266 aa  331  8e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.139852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1593  ribonuclease BN  50.2 
 
 
273 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.949461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1217  tRNA-processing ribonuclease BN  52.99 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.130001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  49.8 
 
 
268 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  49.8 
 
 
276 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  49.8 
 
 
268 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0373  ribonuclease BN  42.75 
 
 
277 aa  199  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  28.09 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.46 
 
 
294 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  29.8 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  29.13 
 
 
290 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  29.41 
 
 
290 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  29.41 
 
 
290 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  29.41 
 
 
290 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  29.41 
 
 
290 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  29.41 
 
 
290 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  28.33 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  29.08 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  29.08 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  27.63 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  29.08 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  27.45 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.45 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.38 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.39 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.39 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.06 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.79 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.39 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  29.14 
 
 
437 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  29.14 
 
 
437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  27.39 
 
 
323 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  29.14 
 
 
437 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  29.14 
 
 
437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  29.14 
 
 
437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.13 
 
 
447 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.16 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.06 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  27.84 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  31.75 
 
 
525 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  31.54 
 
 
525 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  27.8 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.67 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  27.65 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  27.76 
 
 
499 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  29.14 
 
 
436 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  29.14 
 
 
436 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.21 
 
 
412 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.42 
 
 
437 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.7 
 
 
443 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  27.45 
 
 
443 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  27.45 
 
 
443 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.7 
 
 
443 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  28.06 
 
 
442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  26.67 
 
 
444 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  24.7 
 
 
451 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.34 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.41 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.41 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27.27 
 
 
441 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  27.34 
 
 
443 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  27.06 
 
 
294 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  29.1 
 
 
422 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  29.43 
 
 
439 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  28.69 
 
 
426 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.62 
 
 
408 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  26.98 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  31.17 
 
 
538 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  25.72 
 
 
445 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.92 
 
 
405 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  24.51 
 
 
303 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.77 
 
 
310 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.1 
 
 
313 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  26.15 
 
 
436 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  27.4 
 
 
437 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  27.05 
 
 
427 aa  99.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  29.55 
 
 
428 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  27.12 
 
 
432 aa  99  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  27.38 
 
 
403 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  26.64 
 
 
427 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  28.24 
 
 
441 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  25.83 
 
 
411 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.83 
 
 
411 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.23 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  25.6 
 
 
314 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  27.35 
 
 
449 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  25.4 
 
 
433 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.94 
 
 
446 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  22.55 
 
 
416 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  28.29 
 
 
410 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>