227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3965 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  100 
 
 
306 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  49.17 
 
 
322 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  49.17 
 
 
322 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  29.61 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  30.74 
 
 
291 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  29.19 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  26.46 
 
 
316 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  29.43 
 
 
427 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  27.3 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  28.28 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  28.28 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  29.29 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  27.71 
 
 
329 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  27.71 
 
 
329 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  30.32 
 
 
299 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  30.54 
 
 
324 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02291  serum resistance locus BrkB-like protein  26.8 
 
 
314 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  29.15 
 
 
321 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  28.57 
 
 
329 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  27.55 
 
 
317 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01101  serum resistance locus BrkB-like protein  30.93 
 
 
304 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  30.14 
 
 
347 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  27.12 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  29.97 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  28.62 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  27.85 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  28.38 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.12 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  25.58 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  28.93 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01071  serum resistance locus BrkB-like protein  30.95 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  27.05 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  29.14 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  26.06 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2328  serum resistance locus BrkB-like  27.3 
 
 
310 aa  89  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01111  serum resistance locus BrkB-like protein  29.97 
 
 
304 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.970589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  27.11 
 
 
424 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  26.25 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.04 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  25.99 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  28.22 
 
 
393 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.66 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  25.25 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  24.58 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  24.58 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  24.83 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  23.21 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  22.7 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  25.7 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  23.97 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  22.51 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.26 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  22.98 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  22.98 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.17 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  26.28 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  22.79 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  26.99 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.13 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  24.19 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  22.51 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  23.4 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  24.13 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.23 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.84 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.11 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  23.83 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  21.48 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.43 
 
 
377 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.33 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.28 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.91 
 
 
375 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  24.63 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  23.99 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  23.88 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.05 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  22.56 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 
420 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.91 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.91 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.91 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.24 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 
417 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  22.74 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  21.45 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  21.69 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  23.24 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.15 
 
 
374 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  22.58 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  24.41 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.08 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  23.7 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  22.02 
 
 
429 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>