More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4339 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  100 
 
 
350 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
350 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  100 
 
 
350 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  68.71 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  69.39 
 
 
401 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  62.8 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  65.59 
 
 
371 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  59.24 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  61.77 
 
 
377 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  59.36 
 
 
381 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  62.39 
 
 
359 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  55.45 
 
 
367 aa  322  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  51.96 
 
 
328 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  53.16 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  50.98 
 
 
365 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  48.74 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  50 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  52.44 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  48.12 
 
 
301 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  49.34 
 
 
333 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  46.03 
 
 
330 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  48.87 
 
 
420 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  47.24 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  44.33 
 
 
331 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  38.48 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  37.61 
 
 
360 aa  193  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  36.98 
 
 
393 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  39.31 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  41.23 
 
 
328 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  36.27 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  38.21 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  37.87 
 
 
318 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  36.39 
 
 
299 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  37.87 
 
 
318 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  36.39 
 
 
299 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  38.96 
 
 
323 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  40.51 
 
 
321 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  38.79 
 
 
289 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  41.54 
 
 
359 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  36.93 
 
 
363 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  35.96 
 
 
367 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  32.01 
 
 
397 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  32.01 
 
 
397 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  34.38 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  32.82 
 
 
375 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  32.89 
 
 
331 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  31.61 
 
 
396 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  30.27 
 
 
378 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  40.61 
 
 
338 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  34.75 
 
 
317 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  34.72 
 
 
322 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  34.39 
 
 
360 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  34.85 
 
 
316 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30 
 
 
351 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  33.45 
 
 
319 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  33.79 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  35.66 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  33.22 
 
 
316 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  30.58 
 
 
386 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  33.01 
 
 
386 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.93 
 
 
328 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.38 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  39.85 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  39.85 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  32.88 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31.09 
 
 
374 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  31.19 
 
 
351 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  32.88 
 
 
356 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  33.68 
 
 
386 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  32.53 
 
 
388 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  31.65 
 
 
341 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  33.66 
 
 
307 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  32.88 
 
 
386 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  31.13 
 
 
348 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  30.59 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  35.31 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.15 
 
 
313 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  35.37 
 
 
324 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  31.11 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  30.63 
 
 
384 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  33.67 
 
 
322 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  31.37 
 
 
347 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  31.37 
 
 
347 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  31.85 
 
 
406 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  31.99 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  31.19 
 
 
318 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.89 
 
 
321 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  33.22 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.04 
 
 
392 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  32.31 
 
 
289 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  32.17 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.07 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.07 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  32.31 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  33.7 
 
 
277 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>