More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3356 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  100 
 
 		 374 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  51.94 
 
 		 317 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  45.77 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  44.16 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  41.31 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  41.31 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  42.94 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  43.55 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  40.82 
 
 		 328 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  43.08 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  43.42 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  40 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  43.79 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  39.31 
 
 		 414 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  39.52 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  41.94 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.99 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  41.78 
 
 		 375 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  40.49 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  41.03 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  38.92 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  40.49 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  42.21 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  42.81 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  37.92 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  41.1 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  39.54 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  39.54 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  40 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  35.61 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  37.95 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  37.95 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  36.53 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  36.6 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  37.12 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  37 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  34.89 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.62 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  37.04 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  37.58 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  34.78 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  34.8 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  36.51 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  38.97 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.11 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  35.42 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  37.41 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.83 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  30.88 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  33.43 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.69 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  37.69 
 
 		 289 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  39.03 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.13 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  33.55 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  37.31 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  31.53 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  36.7 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.98 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  36.7 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.92 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  35.76 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  36.57 
 
 		 289 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.97 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  34.14 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  33.53 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  32.51 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  30.14 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.54 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.54 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.54 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  30.82 
 
 		 293 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33.74 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  33.14 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.82 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  30.14 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.82 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  32.48 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.24 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  33.92 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.24 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  32.97 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  32.38 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  32.38 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.07 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  30.6 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.64 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  30.6 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  32.43 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  31.97 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>