More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0430 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  100 
 
 		 313 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  39.62 
 
 		 374 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  40.78 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  39.78 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  39.78 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  36.06 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.55 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  36.96 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  39.13 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  41.11 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  40.31 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  39.05 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  39.53 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  36.94 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  36.39 
 
 		 375 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  33.21 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  37.98 
 
 		 386 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  32.85 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  37.55 
 
 		 347 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  37.55 
 
 		 347 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  38.67 
 
 		 388 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.56 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  39.37 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  34.87 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 386 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  32.25 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  35.84 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  33.81 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  35.07 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  35.76 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  31.29 
 
 		 351 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  35.25 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.9 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  32.85 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  37.98 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  37.41 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  36.36 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  36.36 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  34.44 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  32.33 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  32.55 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  33.72 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.65 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  31.85 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  32.6 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.11 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  32.34 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  33.58 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  33.58 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  32.23 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  32.45 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  32.72 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  32.37 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  29.11 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  32.35 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  32.37 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.87 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.45 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  32.87 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.18 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.1 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.86 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.46 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  34.93 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.07 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.46 
 
 		 445 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  31.53 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.72 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.14 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  32.23 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.22 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  30.39 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.39 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  31.9 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.86 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.86 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  32.49 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>