More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6295 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  100 
 
 
351 aa  695    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  75.65 
 
 
347 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  75.65 
 
 
347 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  72.17 
 
 
347 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  71.64 
 
 
348 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  52.6 
 
 
352 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  53 
 
 
386 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  53.4 
 
 
367 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  51.42 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  52.08 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  47.25 
 
 
397 aa  315  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  46.99 
 
 
397 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  47.01 
 
 
396 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  51.12 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  51.12 
 
 
388 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  47.25 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  48.1 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  42.81 
 
 
386 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  47.3 
 
 
384 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  48.44 
 
 
322 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  49.43 
 
 
406 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  45.05 
 
 
330 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  47.52 
 
 
359 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  46.15 
 
 
328 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  45.98 
 
 
322 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  44.9 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  43.73 
 
 
414 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  49.3 
 
 
360 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  46.95 
 
 
373 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  44.16 
 
 
318 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  42.68 
 
 
331 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  43.43 
 
 
351 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  46.93 
 
 
324 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  43.5 
 
 
359 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  39.41 
 
 
320 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  41.1 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  39.46 
 
 
317 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  39.04 
 
 
356 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  38.82 
 
 
332 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  35.22 
 
 
317 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  35.69 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  38.91 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.05 
 
 
313 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  34.65 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  36.09 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.74 
 
 
321 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  39.92 
 
 
318 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.55 
 
 
377 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.4 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  32.75 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  32.87 
 
 
401 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  31.63 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.44 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  29.01 
 
 
402 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  35.48 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.22 
 
 
445 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.43 
 
 
365 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.79 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.1 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  33.86 
 
 
283 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  32.98 
 
 
330 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.17 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.17 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  30.43 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.17 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.66 
 
 
341 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.38 
 
 
301 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.98 
 
 
381 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.88 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  29.94 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.05 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.36 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.22 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  34.69 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  34.69 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.92 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.53 
 
 
367 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  31.7 
 
 
321 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  28.99 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.96 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  30.96 
 
 
319 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.01 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  30.54 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.54 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  29.87 
 
 
331 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.3 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  29.77 
 
 
420 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.95 
 
 
319 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  28.15 
 
 
304 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.86 
 
 
288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.24 
 
 
289 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.86 
 
 
288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.77 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30.15 
 
 
286 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.14 
 
 
359 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  28.78 
 
 
393 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  29.24 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  29.24 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.46 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  29.24 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>