More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1115 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  100 
 
 
347 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  100 
 
 
347 aa  680    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  75.87 
 
 
351 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  75.43 
 
 
347 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  71.26 
 
 
348 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  53.02 
 
 
386 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  51.46 
 
 
352 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  50.29 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  52.43 
 
 
367 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  49.7 
 
 
375 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  47.78 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  50.8 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  50.8 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  44.87 
 
 
397 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  50.8 
 
 
386 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  43.81 
 
 
386 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  44.87 
 
 
397 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  47.6 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  46.62 
 
 
384 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  49.69 
 
 
322 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  45.4 
 
 
330 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  47.08 
 
 
328 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  50.32 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  46.06 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  44.69 
 
 
414 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  45.73 
 
 
359 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  45.71 
 
 
322 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  42.81 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  47.18 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  47.94 
 
 
373 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  48.08 
 
 
324 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  43.2 
 
 
359 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  46.08 
 
 
351 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  43.65 
 
 
320 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  42.53 
 
 
318 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  39.03 
 
 
374 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  42.61 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  36.27 
 
 
317 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  36.62 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  38.96 
 
 
325 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  40.2 
 
 
332 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  35.67 
 
 
307 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  36.98 
 
 
317 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.02 
 
 
321 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  38.98 
 
 
313 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  37.22 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  37.9 
 
 
318 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  33.9 
 
 
293 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  36.21 
 
 
333 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  29.35 
 
 
402 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  30.16 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  30.19 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.56 
 
 
401 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  31.25 
 
 
349 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.48 
 
 
365 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  33.33 
 
 
328 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  28.34 
 
 
377 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  31.37 
 
 
350 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  31.37 
 
 
350 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.63 
 
 
445 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  31.76 
 
 
377 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  31.37 
 
 
350 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.9 
 
 
330 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
283 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.57 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.46 
 
 
341 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.43 
 
 
367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  34.47 
 
 
278 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  32.13 
 
 
328 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  32.57 
 
 
381 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  35.23 
 
 
278 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.09 
 
 
317 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  35.23 
 
 
278 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.09 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  31.79 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.6 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.1 
 
 
331 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.63 
 
 
288 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.63 
 
 
288 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.15 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.86 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.3 
 
 
319 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.78 
 
 
286 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.29 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.09 
 
 
299 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  30.19 
 
 
304 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  30.18 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  31.51 
 
 
420 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  30.55 
 
 
306 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.73 
 
 
299 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  25.48 
 
 
313 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  27.74 
 
 
371 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  29.24 
 
 
317 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.24 
 
 
319 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>