182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1478 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  100 
 
 
304 aa  594  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2706  ribonuclease BN  34.68 
 
 
330 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.87 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  30.51 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  31.73 
 
 
313 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  32.73 
 
 
367 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  32.37 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  30.94 
 
 
347 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  30.94 
 
 
347 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  28.42 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.43 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  33.2 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  30 
 
 
386 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  30.45 
 
 
386 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  30.04 
 
 
375 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.17 
 
 
351 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.94 
 
 
388 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.71 
 
 
317 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  31.25 
 
 
386 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  29 
 
 
348 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  30.38 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  30.38 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.94 
 
 
352 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.57 
 
 
388 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.64 
 
 
384 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.85 
 
 
396 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  29.04 
 
 
359 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  31.37 
 
 
322 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.57 
 
 
414 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.67 
 
 
374 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.24 
 
 
386 aa  99  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  32.42 
 
 
406 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  29.39 
 
 
359 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.57 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27.89 
 
 
360 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.83 
 
 
320 aa  95.9  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  27.78 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  28.03 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
322 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.26 
 
 
351 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.29 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  28.72 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.71 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  30 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  30 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  30.22 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.21 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.93 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.16 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  29.96 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.94 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  28.83 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  28.83 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  25.36 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26.12 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.17 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.58 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  27.04 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.72 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  28.27 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  23.53 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.72 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.22 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.42 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.51 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.94 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  23.91 
 
 
484 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.53 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.89 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.89 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.18 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.09 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.81 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.22 
 
 
392 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.82 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  25.82 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  25.93 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  25.82 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  22.9 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  26.76 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
420 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  25.74 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.67 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  25.74 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  34.09 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  28.44 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  24.19 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  25.74 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  23.05 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  23.05 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>