More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2397 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  64.97 
 
 
386 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  65.07 
 
 
384 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  58.79 
 
 
386 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  58.15 
 
 
386 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  58.71 
 
 
367 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  57.28 
 
 
396 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  56.92 
 
 
388 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  54.74 
 
 
397 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  57.23 
 
 
388 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  54.74 
 
 
397 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  58.02 
 
 
386 aa  361  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  49.56 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  56.92 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  54.66 
 
 
348 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  52.6 
 
 
351 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  54.19 
 
 
322 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  51.46 
 
 
347 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  51.46 
 
 
347 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  56.96 
 
 
406 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  56.54 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  48.39 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  45.71 
 
 
328 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  46.37 
 
 
328 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  47.6 
 
 
359 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  45.63 
 
 
414 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  45.83 
 
 
322 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  53.73 
 
 
351 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  47.69 
 
 
322 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  44.01 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  45.37 
 
 
324 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  43.87 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  47.48 
 
 
356 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  40.67 
 
 
331 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  42.77 
 
 
318 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  48.39 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.13 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  39.8 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  39.29 
 
 
317 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  35.92 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  37.29 
 
 
332 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  38.76 
 
 
325 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  37.29 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.72 
 
 
321 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  36.43 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  34.2 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  35.69 
 
 
328 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  35.02 
 
 
334 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.25 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  34.45 
 
 
367 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.92 
 
 
349 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  35.89 
 
 
347 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  32.01 
 
 
402 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 
283 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.66 
 
 
333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  32.87 
 
 
401 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  35.44 
 
 
371 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  35.42 
 
 
365 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.41 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.41 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.71 
 
 
363 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.41 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  36.67 
 
 
318 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.45 
 
 
445 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.1 
 
 
377 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  34.96 
 
 
278 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.35 
 
 
330 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.64 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  36.07 
 
 
420 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  35.09 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  35.09 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  33.57 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  34.4 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  34.18 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.47 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  36.4 
 
 
306 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.29 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  31.82 
 
 
331 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  32.26 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.92 
 
 
321 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  32.21 
 
 
299 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  33.18 
 
 
323 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.76 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.57 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  30.39 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  35.18 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.71 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  33.78 
 
 
338 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  31 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.39 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.39 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.57 
 
 
318 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  33.47 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.69 
 
 
316 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>