More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  100 
 
 		 381 aa  740    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  59.88 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  60.12 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  60.12 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  60.12 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  61.81 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  56.42 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  52.34 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  51.25 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  55.71 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  54.51 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  53.92 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  61.33 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  54.76 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  46.43 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  49.67 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  45.43 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  43.37 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  47.26 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  46.08 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  47.9 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  49.51 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  44.18 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  37.53 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  41.45 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  41.69 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  41.82 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  35.44 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  34.92 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  33.13 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  33.68 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  33.13 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  37.81 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  35.05 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  33.05 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  34.95 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  34.95 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  34.75 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  34.56 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  34.56 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  36 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  32.58 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  34.56 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  33.98 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  33.64 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  35.07 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  35.62 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  36.54 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  34.49 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  33.63 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  31.14 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  35.66 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  32.21 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  32.48 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  35.46 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  33.81 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  33.87 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 347 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  33.01 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  33.01 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  32.9 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  33.02 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  34.05 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  31.37 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  37.45 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  32.35 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  32.78 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  33.7 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  32.16 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  31.92 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.92 
 
 		 288 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.92 
 
 		 288 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  33.11 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  31.49 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  31.54 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  33.33 
 
 		 286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  33.7 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.92 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  32.52 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.67 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  33 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  31.08 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>