219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  100 
 
 
388 aa  763    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  51.03 
 
 
360 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  35.8 
 
 
402 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  38.22 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  37.61 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  33.89 
 
 
401 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  38.48 
 
 
350 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  38.48 
 
 
350 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  38.48 
 
 
350 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  37.53 
 
 
381 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  38.18 
 
 
371 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  35.38 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  37.85 
 
 
417 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  34.44 
 
 
328 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  34.35 
 
 
347 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  37.46 
 
 
334 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.63 
 
 
330 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  34.25 
 
 
445 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.11 
 
 
333 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  35.64 
 
 
367 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  37.62 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  35.56 
 
 
301 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  38.24 
 
 
359 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.44 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 
420 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  32.89 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  31.03 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.55 
 
 
299 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.86 
 
 
299 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.06 
 
 
316 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.07 
 
 
359 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  31.11 
 
 
322 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  31.27 
 
 
321 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  30.38 
 
 
397 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  30.38 
 
 
397 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.92 
 
 
323 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  32.01 
 
 
463 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  30.09 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.99 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.91 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.5 
 
 
317 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28.83 
 
 
289 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  28.36 
 
 
322 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  29.91 
 
 
318 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.51 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.76 
 
 
277 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.23 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  29.44 
 
 
318 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  29.66 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.08 
 
 
375 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.69 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  30.86 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.36 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.36 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  27 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.48 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.64 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.81 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.83 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  27.01 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.46 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  29.41 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  29.41 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.81 
 
 
286 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.9 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.9 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  28.06 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  29.24 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  27.27 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  22.87 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.28 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  31.43 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  28.31 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.37 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  28.57 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  26.91 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.87 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.64 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  28.24 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  28.24 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.91 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.79 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  26.6 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.44 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26.54 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.6 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  27.96 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.93 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.93 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.01 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  24.92 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  24.07 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>