289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5245 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  100 
 
 
331 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  71.43 
 
 
365 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  45.87 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  54.48 
 
 
420 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  54.55 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  49.28 
 
 
445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  48.24 
 
 
330 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  43.81 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  45 
 
 
367 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  44.33 
 
 
350 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  44.33 
 
 
350 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  44.33 
 
 
350 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  43.28 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  42.9 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  42.44 
 
 
377 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  47.2 
 
 
306 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  42.72 
 
 
377 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  39.86 
 
 
349 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  38.17 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  41.78 
 
 
371 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  41.45 
 
 
381 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  38.49 
 
 
402 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  37.72 
 
 
307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  36.09 
 
 
363 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  33.78 
 
 
374 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  36.65 
 
 
417 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  31.52 
 
 
397 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  35.36 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  31.6 
 
 
397 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  36.56 
 
 
317 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  34.72 
 
 
341 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  30.99 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  40.56 
 
 
359 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  32.7 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  34.59 
 
 
359 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  32.54 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  32.27 
 
 
386 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  36.84 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  35.34 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  36.84 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  31.75 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  31.82 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  32.89 
 
 
388 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.37 
 
 
313 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.29 
 
 
356 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  29.71 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  29.86 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  32.48 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  33.46 
 
 
318 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  33.46 
 
 
319 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  29.13 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  29.84 
 
 
375 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  29.34 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  30.58 
 
 
367 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.91 
 
 
316 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  30.14 
 
 
320 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  32.67 
 
 
289 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  30.67 
 
 
322 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  31.56 
 
 
317 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  30.9 
 
 
384 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.12 
 
 
321 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  31.29 
 
 
289 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.49 
 
 
323 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  30.93 
 
 
386 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.69 
 
 
289 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  31.41 
 
 
286 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  29.48 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  30.82 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.32 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  30.82 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  30.74 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  29.53 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  29.53 
 
 
386 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  30.72 
 
 
360 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.69 
 
 
288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.69 
 
 
288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.32 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  30.1 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  28.16 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  30.1 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.87 
 
 
351 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  29.9 
 
 
406 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.37 
 
 
331 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  30.94 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  30.21 
 
 
318 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.94 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.23 
 
 
414 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  30.49 
 
 
277 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  30.16 
 
 
393 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  27.4 
 
 
291 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  30.46 
 
 
322 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>