144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1770 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  49.83 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  37.72 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  36.18 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  38.99 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  37.87 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  34.95 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  34.34 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  36.24 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  36.4 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  37.09 
 
 		 420 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  34.02 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  34.32 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  31.08 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  34.32 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  34.32 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.84 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 377 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.64 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33 
 
 		 381 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.3 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  37.54 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.5 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.42 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.92 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.92 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.92 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.54 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  28.81 
 
 		 417 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.57 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.32 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.56 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.56 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  25.61 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.41 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.69 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.61 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.33 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30.61 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30.61 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  29.83 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.48 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.89 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.48 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.49 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.13 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.09 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  29.02 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.67 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  22.58 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  26.46 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.26 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.1 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.53 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.08 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.08 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  20.07 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.24 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  25.41 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  23.17 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  23.73 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  23.18 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.45 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  23.59 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.12 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  22.07 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  22.62 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  29.44 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  23.16 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.12 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  28.89 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  23.16 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  27.67 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  21.03 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.22 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  24.56 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>