134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  100 
 
 		 378 aa  741    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  45.57 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  30.49 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.18 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.32 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  31.39 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.12 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  31.95 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  31.95 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  31.95 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.06 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  31.82 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  32.89 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  29.32 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  32.47 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.88 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  31.62 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  29.84 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  30.37 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.23 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  29.21 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.99 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  27.92 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.54 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.17 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.63 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.29 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.32 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.32 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.27 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.91 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.26 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  29.63 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.71 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27.44 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  26.48 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  26.48 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  26.04 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  26.04 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.76 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.83 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.22 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.38 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.49 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.57 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  29.74 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  23.36 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.55 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.61 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.61 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.49 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.72 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.64 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.13 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.93 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  25.29 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  27.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  21.82 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.14 
 
 		 318 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  24.03 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3405  ribonuclease BN  21.51 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  27.46 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.23 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>