129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3405 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3405  ribonuclease BN  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5735  membrane protein-like protein  57.41 
 
 		 379 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.73 
 
 		 377 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.41 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.78 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.92 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.07 
 
 		 377 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.27 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  29.39 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  29.54 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.12 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  30.14 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30.31 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  31.11 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  25.84 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.51 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.88 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  29.44 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.76 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.1 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  26.94 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  33.67 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  31.53 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  28.57 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.84 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.72 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  37.76 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  34.69 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  37.82 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  35.91 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  21.51 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.73 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  21.15 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  32.11 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  35.92 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  34.95 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  34.34 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.23 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  29.3 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  23.43 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  33 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  33.96 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  33 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  36.61 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  25.24 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  21.24 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  22.57 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.58 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  33.51 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.93 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.93 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  32.65 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.05 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 499 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  22.33 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  27.42 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.11 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.57 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  36 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  20.08 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  32.53 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  24.49 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.06 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  31.33 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  21.91 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  21.91 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  21.91 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  21.91 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>