178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5735 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5735  membrane protein-like protein  100 
 
 
379 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3405  ribonuclease BN  57.41 
 
 
324 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.61 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.77 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.19 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25.7 
 
 
334 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  30.41 
 
 
306 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.62 
 
 
328 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  28.99 
 
 
381 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  29.41 
 
 
420 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  27.24 
 
 
365 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.52 
 
 
402 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 
401 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.17 
 
 
367 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.28 
 
 
341 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  26.9 
 
 
377 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  25.86 
 
 
350 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  25.86 
 
 
350 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  25.86 
 
 
350 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.64 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.57 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.21 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.14 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.14 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.86 
 
 
301 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  27.75 
 
 
317 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.62 
 
 
330 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.65 
 
 
331 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  23.47 
 
 
299 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.24 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.27 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  23.47 
 
 
299 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.6 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  29.7 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.62 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26 
 
 
310 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  25.9 
 
 
323 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.56 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.37 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.12 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  22.98 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.24 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.71 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  24.58 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  26.45 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.82 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.75 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  29.06 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.17 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.13 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  26.96 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  24.4 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.36 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.1 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.29 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.25 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.03 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.02 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.58 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.92 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  30.7 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  24.35 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  24.35 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.32 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.8 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  26.13 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  24.35 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  23.77 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.34 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  25.3 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  22.61 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.2 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.59 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.59 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  25.68 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.02 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  23.83 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  32.73 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25.95 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  22.81 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.88 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  26.29 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  32.73 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.43 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.72 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.36 
 
 
313 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  23.96 
 
 
351 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>