More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2184 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  39.02 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  37.36 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  37 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  37.02 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  37.02 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  36.82 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  35.88 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  35.88 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  35.88 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  39.02 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  36.68 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  34.35 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  33.96 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  36.12 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  29.26 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  29.96 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.32 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  33.58 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  32.46 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 363 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.39 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.25 
 
 		 351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  38.1 
 
 		 405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  38.1 
 
 		 405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.96 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  29.71 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.7 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.11 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  29.2 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.61 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  28.84 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.88 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  29.25 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  27.86 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  30.28 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  32.18 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.76 
 
 		 386 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  27.44 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 365 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 396 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  27.37 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 359 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  29.12 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  30.37 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 402 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  26.43 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  27.08 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  27.76 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  30.69 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.69 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.47 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  30.68 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.59 
 
 		 401 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  30.11 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  31.9 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 397 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 397 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  30.08 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 414 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 367 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  28.09 
 
 		 384 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  27.76 
 
 		 352 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  27.37 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  29.37 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.45 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 445 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>