More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1360 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  100 
 
 		 406 aa  797    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  68.7 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  67.81 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  67.81 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  57.77 
 
 		 386 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  61.05 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  56.72 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  61.42 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  54.57 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  54.81 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  54.81 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  56.96 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  54.09 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  49.42 
 
 		 386 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  53.01 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  49.13 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  51.45 
 
 		 322 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  47.92 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  50.32 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  50.32 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  48.76 
 
 		 330 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  50.34 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  50 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  42.31 
 
 		 414 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  55.48 
 
 		 360 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  48.54 
 
 		 328 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  48.73 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  50.34 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  49.2 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  43.98 
 
 		 331 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  49.21 
 
 		 324 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  48.89 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  47.28 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  44.38 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  46.43 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  42.77 
 
 		 318 aa  256  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  40.39 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  49.1 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  41.14 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  37.86 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  40.91 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  38.54 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  37.62 
 
 		 332 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  39.24 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  37.98 
 
 		 313 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  38.22 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  38.83 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  32.24 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  33.23 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  36.06 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  36.77 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  33.55 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  33.45 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  32.3 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  32.51 
 
 		 349 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  34.65 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  34.67 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.04 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  32.99 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  35.4 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.13 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  35.57 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  36.26 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  35.45 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  34.25 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  32.73 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.67 
 
 		 317 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  34.75 
 
 		 291 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.68 
 
 		 316 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  34.53 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  34.73 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  32.4 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  32.4 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  32.76 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  33.93 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.03 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.21 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.86 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  36.12 
 
 		 278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  36.12 
 
 		 278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  34.7 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  34.7 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  34.7 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.51 
 
 		 299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.51 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  32.87 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  32.21 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.32 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  32.21 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>