More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1005 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  46.86 
 
 		 278 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  47.6 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  47.6 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  36.69 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  43.34 
 
 		 293 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  42.21 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  37.41 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  38.49 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  40.73 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  36.36 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  37.5 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  35.74 
 
 		 396 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  36.43 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.65 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  35.07 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  37.5 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  35.1 
 
 		 386 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  38.26 
 
 		 388 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  40.16 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  40.4 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  37.16 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  37.16 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  35.59 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 388 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  39.61 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  37.28 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  36.84 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  38.1 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  32.2 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  37.83 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  37.7 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.34 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  38.83 
 
 		 406 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  34.1 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  38.61 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  34.81 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.5 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  31.33 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  36.11 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  32.3 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  33.11 
 
 		 373 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.17 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  32.37 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  31.76 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  32.01 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  31.7 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  33.47 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  31.72 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.85 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.21 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  31.67 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  33.63 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.35 
 
 		 445 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  32.74 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  33.19 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.74 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  32.31 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.86 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  30.39 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.8 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.26 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.12 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.94 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.15 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  30.25 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.73 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  28.46 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  30.83 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.64 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>