More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4741 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  100 
 
 
359 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  85.67 
 
 
359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  55.06 
 
 
328 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  55.03 
 
 
330 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  56.13 
 
 
322 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  50.46 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  52.2 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  51.79 
 
 
367 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  46.11 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  49.68 
 
 
322 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  47.42 
 
 
397 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  47.57 
 
 
397 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  43.73 
 
 
352 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  47.44 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  51.46 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  50.46 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  49.84 
 
 
386 aa  298  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  48.22 
 
 
388 aa  292  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  48.22 
 
 
388 aa  291  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  43.2 
 
 
347 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  43.2 
 
 
347 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  45.66 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  50.62 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  43.5 
 
 
351 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  48.24 
 
 
406 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  44.17 
 
 
414 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  51.27 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  41.85 
 
 
386 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  44.05 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  41.1 
 
 
384 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  42.94 
 
 
331 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  40.35 
 
 
360 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.46 
 
 
320 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  37 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  40.32 
 
 
318 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  36.62 
 
 
351 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  38.64 
 
 
356 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  34.53 
 
 
317 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  38.24 
 
 
317 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  40.2 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  35.03 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.65 
 
 
321 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  35.05 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  30.7 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  38.08 
 
 
283 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  38.34 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.35 
 
 
313 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  33.02 
 
 
328 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.58 
 
 
402 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  31.54 
 
 
310 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
278 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  33.46 
 
 
278 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.96 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  35.02 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  31.95 
 
 
278 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  31.67 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.23 
 
 
316 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  31.94 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.8 
 
 
293 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.86 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  31.82 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  31.33 
 
 
445 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  28.96 
 
 
363 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.51 
 
 
359 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.31 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.31 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.31 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.84 
 
 
301 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  32.88 
 
 
330 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.18 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  32.61 
 
 
291 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.99 
 
 
289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.35 
 
 
288 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.35 
 
 
288 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.87 
 
 
334 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30 
 
 
286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.85 
 
 
283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  31.87 
 
 
371 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.24 
 
 
323 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.71 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.99 
 
 
289 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.73 
 
 
283 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  31.03 
 
 
365 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.94 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.86 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.14 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.1 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  32.14 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.5 
 
 
318 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 
318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  31.11 
 
 
367 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.45 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  34.04 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.12 
 
 
381 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>