210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2623 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 278 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  94.96 
 
 		 278 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  94.96 
 
 		 278 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  46.54 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  35.09 
 
 		 384 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  36.16 
 
 		 351 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  34.08 
 
 		 386 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  33.21 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  34.96 
 
 		 352 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  31.69 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  36.26 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  36.02 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.87 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31.94 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  32.05 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  29.6 
 
 		 321 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  33.6 
 
 		 347 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  33.08 
 
 		 388 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  33.84 
 
 		 386 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  33.88 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  29.46 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.86 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  33.88 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 347 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 347 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  32.96 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  31.03 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 328 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  32.83 
 
 		 322 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  31.79 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  33.07 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  34.56 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 396 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  31.2 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  31.2 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  35.25 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  29.28 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 291 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  29.26 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  33.46 
 
 		 373 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 414 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.09 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 406 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.77 
 
 		 417 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  32.06 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 402 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 316 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 347 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.69 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.24 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.43 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.24 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 445 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.52 
 
 		 401 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  26.82 
 
 		 371 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.48 
 
 		 392 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  31.7 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  33.64 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  28.89 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  31.16 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.62 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.62 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.7 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  33.53 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.95 
 
 		 321 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.78 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.78 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.78 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.02 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  23.05 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>