More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3912 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 386 aa  774    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  62.22 
 
 		 352 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  65.36 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  48.89 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  50.29 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  46.52 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  53.57 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  49.55 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  48.77 
 
 		 386 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  48.57 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  46.62 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  49.69 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  49.38 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  47.86 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  47.44 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  53.29 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  43.81 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  48.73 
 
 		 322 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  43.81 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  42.81 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  49.42 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  46.25 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  43.09 
 
 		 328 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  43.45 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  40.06 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  41.46 
 
 		 359 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  45.22 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  41.53 
 
 		 322 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  39.29 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  40.2 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  43.03 
 
 		 373 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  44.76 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  41.85 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  43.73 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  39.23 
 
 		 331 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.11 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  35.88 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  36.39 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  36.83 
 
 		 317 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.97 
 
 		 321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  37.2 
 
 		 317 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  36.71 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  34.74 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  36.7 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  32.54 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.85 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  33.87 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  32.35 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  35 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  32.65 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  36.43 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  32.86 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.58 
 
 		 283 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.09 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  34.46 
 
 		 278 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 278 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.59 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  34.08 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  33.78 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.58 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.58 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.58 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.14 
 
 		 445 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  33.84 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  33.84 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  32.13 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  31.8 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  34.63 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  32.16 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.97 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.81 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  34.63 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.78 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  34.5 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.59 
 
 		 289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30.38 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  32.23 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.8 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.8 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.94 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  33 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>