285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2494 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  100 
 
 		 332 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  36.53 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  36.11 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  40.5 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  37.22 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  34.73 
 
 		 317 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  38.82 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  36.91 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  36.07 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  36.5 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  38.29 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  38.56 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  37.78 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  38.32 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  35.58 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  40.58 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  35.58 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  40.58 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  34.93 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  39.68 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  35.5 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 414 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  34.48 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  35.03 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  33.96 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  34.8 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31.58 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  33.54 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  35.22 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  35.44 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  37.62 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  37.72 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  35.22 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  35.82 
 
 		 307 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  31.01 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  35.82 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  35.19 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  32.62 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  32.51 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.81 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  28.67 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.58 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.23 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.4 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  30 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.78 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  28.32 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  29.56 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.1 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.21 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  29.15 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.6 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.12 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  32 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.32 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.61 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.61 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30.67 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30.67 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  28.87 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.85 
 
 		 377 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  29.87 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.52 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.67 
 
 		 328 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  30.74 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  31.27 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  28.61 
 
 		 417 aa  89.7  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2706  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  25.7 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  26.9 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  24.65 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.44 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>