282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2816 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 293 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  44.85 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  39.69 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  39.69 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  36.3 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  32.65 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  36.18 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  30.8 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 396 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 397 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31.06 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  32.22 
 
 		 384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  35.94 
 
 		 348 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  31.96 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.21 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  30.82 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  33.21 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 351 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  30.03 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.4 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.38 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  33.92 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  34.47 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  32.63 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  29.11 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  31.42 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  32.22 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  31.79 
 
 		 330 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  31.39 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  31.39 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  33.46 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  29.56 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  29.6 
 
 		 414 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  30.8 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  29.86 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  31.08 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.41 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.76 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.76 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.67 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.61 
 
 		 359 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.17 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.18 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 334 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.74 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.54 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 363 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.14 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.68 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.07 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  27.74 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.49 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.82 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.02 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.55 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  31.84 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.38 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.11 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.79 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  26.98 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.1 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  28.36 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.52 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.52 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.52 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>