299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1844 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  100 
 
 
330 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  40.14 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  41.31 
 
 
318 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  35.84 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  35.12 
 
 
307 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  34.93 
 
 
310 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  33.44 
 
 
307 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  35.22 
 
 
303 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  32.58 
 
 
288 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  32.58 
 
 
288 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  33.83 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  32.2 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  34.51 
 
 
289 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  30.1 
 
 
316 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.97 
 
 
289 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  28.62 
 
 
277 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  33.09 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  33.71 
 
 
295 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  28.95 
 
 
283 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.39 
 
 
317 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.22 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.48 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.57 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.07 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.4 
 
 
323 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  29.25 
 
 
374 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  29.8 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  31.4 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  29.28 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  32.18 
 
 
276 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  31.07 
 
 
319 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  28.01 
 
 
328 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.36 
 
 
317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.71 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.45 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  30.71 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  29.14 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  27.38 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.88 
 
 
277 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  29.21 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.88 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  29.21 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.46 
 
 
396 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  26.81 
 
 
350 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 
350 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 
350 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  30.48 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  30.71 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  30.8 
 
 
321 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.28 
 
 
322 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  29.81 
 
 
386 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.37 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.86 
 
 
318 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.64 
 
 
377 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.04 
 
 
388 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  31.18 
 
 
386 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.04 
 
 
388 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.94 
 
 
351 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.52 
 
 
363 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.12 
 
 
322 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.74 
 
 
347 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.6 
 
 
331 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  29.06 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.91 
 
 
401 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  29.07 
 
 
386 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.82 
 
 
352 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.04 
 
 
356 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.34 
 
 
349 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.86 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.24 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.21 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  29.15 
 
 
375 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  33.49 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  28.98 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.39 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  26.98 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  25.79 
 
 
297 aa  95.9  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  28.84 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  27.24 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  25.45 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  27.24 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.97 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.28 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25.24 
 
 
371 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.85 
 
 
445 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  27.39 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  26.62 
 
 
348 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25 
 
 
347 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  29.75 
 
 
347 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  28.09 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  29.75 
 
 
347 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  28.09 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>