More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1298 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  100 
 
 
277 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  77.62 
 
 
277 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  51.84 
 
 
288 aa  295  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  51.84 
 
 
288 aa  295  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  50.37 
 
 
289 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  50.37 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  49.63 
 
 
289 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  50 
 
 
286 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  39.02 
 
 
276 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  38.61 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  37.84 
 
 
283 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  39.78 
 
 
392 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  41.24 
 
 
316 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  38.83 
 
 
299 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  39.19 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  38.49 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  37.05 
 
 
316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  37.37 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  34.19 
 
 
359 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  36.26 
 
 
328 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  37.08 
 
 
289 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  38.95 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  33.21 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  38.06 
 
 
323 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  37.83 
 
 
321 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  36 
 
 
401 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
341 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  39.77 
 
 
405 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  39.77 
 
 
405 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  35.66 
 
 
402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  38.43 
 
 
319 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  38.43 
 
 
318 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  38.43 
 
 
318 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  32.97 
 
 
367 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  32.95 
 
 
349 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  33.82 
 
 
377 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  30.66 
 
 
320 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  28.57 
 
 
319 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  33.8 
 
 
356 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  30.74 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  32.13 
 
 
333 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.34 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.34 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.34 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.93 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  35.93 
 
 
328 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 
377 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  31.56 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  34.07 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  35.59 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.12 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  33.46 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  33.46 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  33.97 
 
 
317 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  29.04 
 
 
296 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  30.71 
 
 
334 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  29.54 
 
 
321 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.7 
 
 
445 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.29 
 
 
317 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  32.98 
 
 
302 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  29.09 
 
 
330 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.84 
 
 
347 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  26.2 
 
 
313 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  31.27 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.33 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  27.84 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  33.21 
 
 
420 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  33.08 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  30.29 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  34.72 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  36.3 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.48 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  28.04 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  31.15 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  27.2 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  30.18 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  31.72 
 
 
386 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.49 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  31.85 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  30.83 
 
 
386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  31.85 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  31.99 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  32.22 
 
 
386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  27.08 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  30.11 
 
 
328 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  31.21 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  30.2 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  28.88 
 
 
318 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  26.39 
 
 
323 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.81 
 
 
367 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.58 
 
 
371 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  30.22 
 
 
414 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  27.04 
 
 
301 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  30.15 
 
 
331 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>