More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3869 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  100 
 
 
401 aa  797    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  67.36 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  68.88 
 
 
350 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  68.88 
 
 
350 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  68.88 
 
 
350 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  55.12 
 
 
402 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  56.38 
 
 
377 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  57.77 
 
 
371 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  59.12 
 
 
377 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  52.97 
 
 
381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  58.21 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  50.83 
 
 
367 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  48.68 
 
 
328 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  47.3 
 
 
445 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  50.33 
 
 
365 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  46.04 
 
 
334 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  46.34 
 
 
347 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  45.14 
 
 
333 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  47.22 
 
 
301 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  44.31 
 
 
330 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  49.35 
 
 
306 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  45.35 
 
 
417 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  42.11 
 
 
420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  42.64 
 
 
331 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  34.73 
 
 
388 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  35.45 
 
 
393 aa  190  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  40.14 
 
 
328 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  35.18 
 
 
360 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  42.07 
 
 
359 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  32.01 
 
 
397 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  36.53 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  32.73 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  31.79 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  37.69 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  36.19 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  32.06 
 
 
396 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  35.66 
 
 
367 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  34.32 
 
 
331 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  40.59 
 
 
338 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  35.59 
 
 
322 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  41.33 
 
 
338 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  41.33 
 
 
338 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  33.44 
 
 
386 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  32.98 
 
 
375 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31.85 
 
 
374 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  33.22 
 
 
388 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  31.33 
 
 
386 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  35.14 
 
 
299 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  31.65 
 
 
386 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  37.55 
 
 
289 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  32.57 
 
 
351 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  32.89 
 
 
388 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  29.68 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  33.88 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  37.83 
 
 
319 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  32.46 
 
 
328 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  34.78 
 
 
299 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  30.99 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  31.79 
 
 
352 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  37.45 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  37.45 
 
 
318 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  34.18 
 
 
277 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09370  predicted membrane protein  30.12 
 
 
378 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  36.94 
 
 
316 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  36.77 
 
 
317 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  38.06 
 
 
317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  38.43 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  38.43 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  31.65 
 
 
319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  32.53 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  30.39 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.5 
 
 
347 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  30.12 
 
 
348 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  33.82 
 
 
317 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.39 
 
 
414 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  34.34 
 
 
322 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  29.25 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.36 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  30.99 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  33.33 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.14 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  30.99 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  31.67 
 
 
406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  36.82 
 
 
277 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  33.45 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  34.04 
 
 
322 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.62 
 
 
313 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.17 
 
 
321 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  35.12 
 
 
373 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  36.06 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  33.09 
 
 
289 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  33.09 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  33.95 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  32.86 
 
 
283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>