More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0800 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  100 
 
 		 386 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  92.53 
 
 		 388 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  92.27 
 
 		 388 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  75.07 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  62.92 
 
 		 386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  64.08 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  60.76 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  55.7 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  54.27 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  54.15 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  58.15 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  55.24 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  52.72 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  48.4 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  49.58 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  53.4 
 
 		 322 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  47.25 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  51.59 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  50.8 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  50.8 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  47.26 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  50 
 
 		 330 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  49.51 
 
 		 322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  50 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  49.71 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  48.7 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  49.84 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  46.71 
 
 		 359 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  48.48 
 
 		 351 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  45.02 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  48.54 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  47.86 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  46.62 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  46.62 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  49.48 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  41.04 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  42.9 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  39.81 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  39.54 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  38.51 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  38.06 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  36.69 
 
 		 307 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  36.57 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  35.76 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  35.41 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  38.41 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.23 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  38.41 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  34.27 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.2 
 
 		 283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  32.89 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.83 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  32.46 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  32.36 
 
 		 445 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  32.41 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  34.75 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.98 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  32.88 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  32.88 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  32.88 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.3 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  35.85 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.77 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.84 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  35.87 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  33.92 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.12 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  34.6 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  34.6 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  35.06 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.76 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.58 
 
 		 288 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  31.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.91 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.58 
 
 		 288 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  31.18 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  31.46 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  31.84 
 
 		 291 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.42 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.93 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.55 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  31.99 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  33.56 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  30.49 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 321 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  34 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  34 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>