More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2469 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  88.44 
 
 
396 aa  696    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  100 
 
 
397 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  98.99 
 
 
397 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  69.87 
 
 
406 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  63 
 
 
367 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  58.38 
 
 
386 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  60.26 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  55.7 
 
 
386 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  57.22 
 
 
375 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  53.37 
 
 
388 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  53.37 
 
 
388 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  54.74 
 
 
352 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  49.55 
 
 
386 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  50.47 
 
 
347 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  46.99 
 
 
351 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  52.22 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  49.2 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  55.79 
 
 
360 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  43.96 
 
 
328 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  48.88 
 
 
348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  44.87 
 
 
347 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  44.87 
 
 
347 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  43.42 
 
 
414 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  45.83 
 
 
322 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  45.27 
 
 
359 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  44.31 
 
 
328 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  46.48 
 
 
331 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  43.03 
 
 
330 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  45.51 
 
 
351 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  46.45 
 
 
359 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  49.1 
 
 
356 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  45.08 
 
 
322 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  45.86 
 
 
324 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  45.86 
 
 
373 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  40.07 
 
 
320 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  44.19 
 
 
374 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  49.29 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  40.51 
 
 
318 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  38.39 
 
 
317 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  42.21 
 
 
317 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  39.48 
 
 
325 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  38.06 
 
 
307 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  34.77 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  35.62 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.78 
 
 
313 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  36.84 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  36.98 
 
 
328 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  32.36 
 
 
377 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  36.63 
 
 
445 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  36.42 
 
 
334 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  38.46 
 
 
333 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.25 
 
 
363 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  34.38 
 
 
402 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.85 
 
 
377 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.45 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  34.71 
 
 
318 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  33.57 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.45 
 
 
330 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  30.74 
 
 
367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  33.95 
 
 
293 aa  146  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.63 
 
 
365 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  33.43 
 
 
347 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.33 
 
 
371 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  31.71 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  31.71 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  31.71 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  33.1 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  31.6 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  35.59 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  34.8 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  33.8 
 
 
306 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  29.25 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  33.77 
 
 
317 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.09 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  30.04 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  31.97 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33.01 
 
 
381 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.03 
 
 
341 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.63 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  30.14 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.34 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.3 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30.07 
 
 
286 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.32 
 
 
289 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  33.21 
 
 
291 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.94 
 
 
338 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.37 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  33.77 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  28.47 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.47 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30.94 
 
 
338 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  29.96 
 
 
289 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30.94 
 
 
338 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.6 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>