More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4350 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  100 
 
 		 316 aa  634    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  82.66 
 
 		 323 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  84.03 
 
 		 321 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  83.49 
 
 		 317 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  82.81 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  83.86 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  82.81 
 
 		 318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  69.15 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  69.15 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  66.78 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  40.8 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  38.67 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  38.33 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  40.07 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  41.05 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  37.79 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  39.59 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.76 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  38.73 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  35.53 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  36.3 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  32.64 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  36.62 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  38.24 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  38.24 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  38.24 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  38.38 
 
 		 445 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  33.95 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  36.33 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  33.95 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  34.21 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  35.06 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  34.21 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  35.59 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  37.69 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  36.57 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  35.96 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  43.78 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  43.32 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  43.32 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.62 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.26 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.8 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  38.38 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  32.4 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.77 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  30.38 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  32.32 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  31.94 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  32.75 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  29.52 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.82 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  35.56 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  30.92 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  32.35 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.47 
 
 		 352 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  30.25 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  30.39 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  31.93 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 291 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  32.29 
 
 		 417 aa  122  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  30.99 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  30.6 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  30.04 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  28.85 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  28.31 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.05 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  27.65 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  33.59 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 388 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  36.16 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  28.32 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  33.92 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  32.53 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.1 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.42 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  28.83 
 
 		 351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.84 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>