More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3781 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  100 
 
 
321 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  94.41 
 
 
323 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  84.03 
 
 
316 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  82.81 
 
 
317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  85.35 
 
 
318 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  85.35 
 
 
318 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  85.35 
 
 
319 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  69.79 
 
 
299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  69.79 
 
 
299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  67.84 
 
 
289 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  39.67 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  40.21 
 
 
316 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  39.72 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  39.73 
 
 
328 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  38.62 
 
 
347 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  40.73 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  34.23 
 
 
319 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  37.93 
 
 
328 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  38.44 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  36.79 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  34.98 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  36.57 
 
 
277 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  37.31 
 
 
330 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  38.83 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  38.83 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  38.83 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  36.04 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  38.15 
 
 
445 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  37.88 
 
 
377 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  35 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  34.95 
 
 
334 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  35.69 
 
 
289 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  36.4 
 
 
349 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  38.43 
 
 
401 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  35.09 
 
 
288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  35.09 
 
 
288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  43.89 
 
 
338 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  44.34 
 
 
338 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  34.95 
 
 
367 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  43.89 
 
 
338 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  35.17 
 
 
286 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  32.19 
 
 
320 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  36.67 
 
 
420 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.29 
 
 
365 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  33.94 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  37.06 
 
 
306 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.64 
 
 
392 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  37.83 
 
 
277 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.08 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33.82 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  36.47 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  31.42 
 
 
283 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  32.99 
 
 
328 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  34.22 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  31.03 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  36.79 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.79 
 
 
317 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  30.87 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  30.61 
 
 
384 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  30.16 
 
 
386 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.42 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  28.78 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.83 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  30.38 
 
 
322 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  30.99 
 
 
386 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.49 
 
 
367 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  32.01 
 
 
331 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  31.8 
 
 
386 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.56 
 
 
417 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  29.05 
 
 
330 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  32.23 
 
 
331 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  30.82 
 
 
375 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.63 
 
 
351 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  29.77 
 
 
321 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  29.29 
 
 
348 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  30.18 
 
 
310 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  28.87 
 
 
291 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  36.16 
 
 
359 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  28.04 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  30.03 
 
 
302 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.95 
 
 
328 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  31.18 
 
 
317 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.67 
 
 
388 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  26.83 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  35.63 
 
 
297 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.67 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  31.4 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  32.88 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  31.01 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  29.12 
 
 
356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  29.77 
 
 
359 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.34 
 
 
397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.05 
 
 
397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  27.89 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>