More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3110 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  100 
 
 		 347 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  77.23 
 
 		 348 aa  544  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  75.43 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  75.43 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  72.17 
 
 		 351 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  49.56 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  54.49 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  55.56 
 
 		 386 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  49.57 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  52.71 
 
 		 375 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  50.43 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  50.47 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  50.47 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  52.72 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  51.76 
 
 		 388 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  46.62 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  51.76 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  45.71 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  48.65 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  54.09 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  47.77 
 
 		 322 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  45.78 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  45.71 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  46.95 
 
 		 322 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  46.15 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  47.78 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  50.7 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  43.73 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  45.34 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  48.56 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  47.44 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  48.55 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  41.54 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  41.99 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  42.02 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  39.8 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  41.22 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  36.39 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  36.99 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  40.13 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  36.69 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  35.33 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.53 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.12 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  36.09 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  40.73 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  29.74 
 
 		 377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.06 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  36.65 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  34.75 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  36.18 
 
 		 293 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.99 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.85 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.44 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.03 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.03 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.03 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  34.12 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.91 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  34.18 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  29.43 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.78 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  30.19 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  34.41 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.37 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.87 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.09 
 
 		 288 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.09 
 
 		 288 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.77 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.77 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  28.24 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.84 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.89 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30.4 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.32 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  23.79 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2706  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.8 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.05 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.05 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>