126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2706 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2706  ribonuclease BN  100 
 
 
330 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  34.67 
 
 
304 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.52 
 
 
331 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  29.48 
 
 
328 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.8 
 
 
347 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  29.45 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  29.45 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.16 
 
 
414 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.42 
 
 
352 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.82 
 
 
386 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  29.7 
 
 
328 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  30.35 
 
 
351 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  29.02 
 
 
384 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.72 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  29.76 
 
 
348 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  28.4 
 
 
322 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.72 
 
 
397 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  29.55 
 
 
359 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  28.33 
 
 
386 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.09 
 
 
367 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  30.18 
 
 
386 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.67 
 
 
396 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  29.6 
 
 
359 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.17 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  27 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.59 
 
 
375 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.56 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.4 
 
 
318 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.68 
 
 
388 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.4 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  28.68 
 
 
386 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.68 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.78 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  27.99 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  31.67 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  28.11 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  28.14 
 
 
324 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.73 
 
 
322 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.33 
 
 
374 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  26.48 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.42 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  26.2 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  25.19 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  23.9 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  25.82 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  28.68 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  26.16 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  22.19 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.48 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.48 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.27 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.37 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.11 
 
 
347 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.26 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  24.76 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.82 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  27.68 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  21.88 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  27.68 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.67 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  22.67 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.71 
 
 
299 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.69 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.86 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.31 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  23.93 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 
289 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  23.94 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.99 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  23.49 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.15 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  20.07 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.46 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  22.04 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  36.78 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  36.78 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  18.44 
 
 
283 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.45 
 
 
445 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  24.8 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  19.01 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  35.24 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  24.82 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  24.82 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  24.82 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  24.82 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  24.82 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  21.58 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  25.7 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  24.22 
 
 
334 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>