266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0036 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  100 
 
 
283 aa  549  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  43.86 
 
 
321 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  37.92 
 
 
331 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  32.48 
 
 
317 aa  168  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  38.61 
 
 
359 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  35.32 
 
 
396 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  34.94 
 
 
397 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  34.94 
 
 
397 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  36.33 
 
 
328 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  35.4 
 
 
386 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31.6 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  39.34 
 
 
322 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  39.04 
 
 
351 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  37.02 
 
 
367 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  35.87 
 
 
414 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  35.07 
 
 
356 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  34.53 
 
 
374 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  36.13 
 
 
386 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  36.65 
 
 
347 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  36.68 
 
 
359 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  36 
 
 
386 aa  148  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  34.75 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  35.2 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  36.54 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  33.46 
 
 
388 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  34.26 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  32.57 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  37.1 
 
 
317 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  31.58 
 
 
386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 
322 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  38.22 
 
 
406 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  31.75 
 
 
384 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  36 
 
 
360 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  35.14 
 
 
318 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  34.8 
 
 
325 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  34.19 
 
 
348 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  31.65 
 
 
313 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  31.14 
 
 
278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  31.14 
 
 
278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  31.87 
 
 
278 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  31.5 
 
 
318 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  33.33 
 
 
373 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  33.86 
 
 
351 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  34.38 
 
 
293 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  35.42 
 
 
322 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  32.69 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  31.92 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  32.69 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  33.6 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  29.3 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  30.96 
 
 
304 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.29 
 
 
333 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.99 
 
 
288 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.99 
 
 
288 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  32.06 
 
 
286 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  30.26 
 
 
363 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.05 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  30.63 
 
 
330 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  29.62 
 
 
349 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.6 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.71 
 
 
402 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.6 
 
 
347 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  29.85 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.15 
 
 
359 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.68 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.8 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  28.52 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.04 
 
 
401 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  30.88 
 
 
365 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.41 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.84 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  26.2 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.84 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.04 
 
 
277 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  31.16 
 
 
371 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  26.8 
 
 
371 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.5 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.35 
 
 
301 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.89 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.89 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.89 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  31.05 
 
 
445 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  27.72 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.78 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.41 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.48 
 
 
392 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  28.68 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.41 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.41 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.14 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>