264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4751 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 330 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  57.46 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  57.14 
 
 		 322 aa  351  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  54.77 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  57.19 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  55.03 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  48.39 
 
 		 352 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  50 
 
 		 386 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  47.28 
 
 		 367 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  49.37 
 
 		 388 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  49.05 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  45.71 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  44.74 
 
 		 348 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  45.4 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  49.05 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  43.03 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  43.03 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  49.05 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  42.73 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  45.05 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  45.4 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  45.4 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  48.76 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  40.06 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  43.34 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  51.11 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  43.69 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  50.63 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  42.12 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  39.82 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  38.71 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  35.83 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  38.71 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  42.4 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  36.6 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  41.47 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  40.46 
 
 		 356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  39.37 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  37.99 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  37.78 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  35.29 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  35.23 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  33.88 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  38.8 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.85 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  34.75 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  31.92 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  31.51 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.61 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.05 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.42 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  29.46 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  31.01 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.81 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  31.01 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.95 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.95 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.06 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.74 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.79 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.24 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.88 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  31.54 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.9 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.61 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.28 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.45 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.1 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.97 
 
 		 401 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.72 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  29.57 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  30.15 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.67 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.63 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.07 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  30.36 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.75 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  30.72 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.58 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.62 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.62 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.62 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.06 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  28.66 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>