More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4678 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  100 
 
 		 347 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  61.02 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  51.99 
 
 		 349 aa  305  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  53.16 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  53.16 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  53.16 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  52.38 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  50.81 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  49.68 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  46.15 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  51.01 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  55.09 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  47.37 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  46.52 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  54.76 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  42.69 
 
 		 445 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  51.36 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  48.65 
 
 		 333 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  48.19 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  46.88 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  38.17 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  48.35 
 
 		 306 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0818  ribonuclease BN  49.38 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  38.73 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  37.81 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  37.1 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  40.41 
 
 		 417 aa  185  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  38.62 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  34.35 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  38.36 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  36.98 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  37.81 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  37.81 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  39.79 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  37.46 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  35.89 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  33.67 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  39.54 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  37.55 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  36.53 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  33.78 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  33.43 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  33.43 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  32.22 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  32.96 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 396 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  38.35 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  33.82 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  35.11 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  34.63 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  35.56 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  34.03 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  35.85 
 
 		 386 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  33.8 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  36.2 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  32.05 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  35.94 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  35.94 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  30.61 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  31.91 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  35.66 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  34.34 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  31.07 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.99 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  32.36 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  32.5 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  33.71 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.09 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  34.3 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.47 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  36.43 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  29.1 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.86 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.86 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1770  ribonuclease BN  29.64 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  30.98 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  33.69 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  34.02 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  31.09 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  31.09 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 406 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  31.08 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  32.56 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  32.55 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  31.84 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.23 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>