More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4597 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
351 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  63.58 
 
 
356 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  65.25 
 
 
317 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  47.46 
 
 
396 aa  292  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  53.73 
 
 
352 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  47.21 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  46.4 
 
 
386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  46.25 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  45.51 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  46.45 
 
 
397 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  45.45 
 
 
375 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  48.48 
 
 
386 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  50 
 
 
367 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  50.69 
 
 
388 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  41.54 
 
 
347 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  50.35 
 
 
388 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  43.43 
 
 
351 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  49.82 
 
 
360 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  46.91 
 
 
386 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  44.76 
 
 
322 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  46.08 
 
 
347 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  46.08 
 
 
347 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  50.34 
 
 
406 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  45.35 
 
 
348 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  42.23 
 
 
414 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  41.43 
 
 
328 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  41.58 
 
 
322 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  39.52 
 
 
359 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  41.69 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  41.54 
 
 
373 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  37.25 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  41.47 
 
 
330 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  37.64 
 
 
320 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  37.34 
 
 
331 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  37.85 
 
 
318 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  40.69 
 
 
322 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  37.46 
 
 
359 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  35.57 
 
 
374 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  33.45 
 
 
317 aa  188  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  33.94 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  33.55 
 
 
307 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  35.16 
 
 
328 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  39.04 
 
 
283 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  31.29 
 
 
313 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  36.65 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  33.69 
 
 
332 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  35.08 
 
 
333 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  32.36 
 
 
310 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  32.65 
 
 
317 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  36.16 
 
 
278 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  34.24 
 
 
334 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.67 
 
 
401 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  31.96 
 
 
377 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  33.82 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.31 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  36.46 
 
 
278 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  36.46 
 
 
278 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.22 
 
 
330 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.1 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  34.62 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  30.19 
 
 
363 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  31.72 
 
 
328 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  31.41 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.22 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.06 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.06 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.36 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.06 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  30.98 
 
 
377 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.77 
 
 
445 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  31.41 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.07 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 
293 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.6 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  33.2 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  30.07 
 
 
283 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  29.75 
 
 
319 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.21 
 
 
381 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.1 
 
 
283 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  33.23 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  31.8 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  29.13 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  29.26 
 
 
277 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  31.34 
 
 
301 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  30.25 
 
 
276 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.71 
 
 
299 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.71 
 
 
299 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.83 
 
 
316 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  33.33 
 
 
289 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  32.14 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.22 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  32.14 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  33.08 
 
 
289 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  29.45 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  32.71 
 
 
286 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>