More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1421 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 392 aa  790    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  66.33 
 
 		 405 aa  448  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  66.33 
 
 		 405 aa  448  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  40.93 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  40.93 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  40.62 
 
 		 289 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  38.77 
 
 		 289 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  39 
 
 		 286 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  36.23 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  36.68 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  36.23 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  39.78 
 
 		 277 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  34.5 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.26 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  33.84 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  34.28 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  33.77 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.45 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.27 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.71 
 
 		 299 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.84 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.64 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.92 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.71 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.03 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  30.09 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.99 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  32.19 
 
 		 333 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  31.85 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  33.02 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.36 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.5 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  33.45 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  32.35 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  32.37 
 
 		 338 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  32.37 
 
 		 338 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  31.47 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.93 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  31.63 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  31.63 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.8 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  34.6 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.24 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.53 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.53 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.53 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.43 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 334 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  33.45 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.94 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.22 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  30 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  31.49 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  29.7 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  32.04 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 365 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  31.62 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  27.43 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  31.84 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  31.76 
 
 		 274 aa  116  6e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 302 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  30.11 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  31.37 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  31.09 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  29 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  28.81 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  25.8 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  32.35 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 317 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  36.18 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  32.11 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  26.69 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  30.06 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>