More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1616 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  100 
 
 		 318 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  42.66 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  40.7 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  35.4 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  37.55 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  34.66 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  32.13 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  32.96 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  32.46 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  34.77 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.32 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.32 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.71 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.43 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  31.63 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.82 
 
 		 286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  31.63 
 
 		 397 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  31.4 
 
 		 396 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.21 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  31.94 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.85 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.24 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.62 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.04 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.47 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.73 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 367 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  28.92 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.01 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  28.48 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  29.14 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  34.18 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  30.26 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.93 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  31.76 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  31.63 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27.15 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  28.62 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  28.88 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.26 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.21 
 
 		 401 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.96 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  29.18 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  28.28 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  32.49 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.57 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.98 
 
 		 360 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  32.08 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.57 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  29.83 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  27.11 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  30.91 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.68 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.68 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.68 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  27.97 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  22.64 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  27.97 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.68 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.22 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  29.73 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>