215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3487 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  100 
 
 
307 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  47.54 
 
 
307 aa  279  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  46.03 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  31.76 
 
 
323 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  31.35 
 
 
318 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  33.67 
 
 
330 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  32.29 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  29.96 
 
 
313 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.91 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  30.68 
 
 
295 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.35 
 
 
363 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.95 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.95 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.85 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.56 
 
 
289 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.1 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.88 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.49 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.78 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.78 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.94 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.68 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  26.62 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.12 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.93 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.2 
 
 
317 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.27 
 
 
299 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.94 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  26.46 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.69 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  23.51 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  23.46 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  26.12 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.44 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.48 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.48 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  23.14 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.16 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  24.52 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  22.78 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.63 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.92 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  24.9 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.35 
 
 
388 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  25 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.92 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  23.62 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  22.35 
 
 
331 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  26.98 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.97 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  22.61 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  23.74 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.58 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.64 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  27.59 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  22.1 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  21.48 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  22.9 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  23.85 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  23.14 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.51 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  24.73 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.79 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.39 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  23.42 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  23.44 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.6 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  21.18 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  26.85 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  26.85 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.48 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  23.45 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  23.83 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  23.9 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  21.79 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  23.41 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  28 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  28 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.48 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  23.41 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  44.59 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  23.32 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  28.48 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  21.2 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  22.81 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.48 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  22.48 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  22.96 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.83 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>