190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08426 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  607  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  52.65 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  47.54 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  35.12 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  34.35 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  27.45 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  28.15 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.48 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.9 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.14 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.05 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.9 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.9 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.19 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.9 
 
 		 392 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.02 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.86 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 363 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.69 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.82 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.63 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.43 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.8 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.51 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.4 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  25.78 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.6 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.62 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  26.2 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.17 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.14 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.36 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  28.09 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  28.09 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  23.27 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  23.64 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  22.96 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  24.55 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.81 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  26.12 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  21.26 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  20.08 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.38 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.8 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.4 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  23.83 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  21.91 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.75 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  26.72 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  21.74 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  24.8 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  21.26 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  23.31 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  31.03 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  27.72 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  24.43 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  27.72 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>